前身为1835年创办的中国第一家西医院——眼科医局，1993年成为广州首家三甲医院，2002年1月海珠区南院区正式启用，是三级甲等综合医院分院区，与北院区（沿江西路107号）实行统一管理、资源共享。

南院区功能定位为区域肿瘤诊疗中心，规划床位1100张，占地约1.8万㎡，规划建筑面积约11.7万㎡，主要建筑有逸仙楼、博爱楼。

院址：广州市海珠区盈丰路33号。

南院区开设内分泌内科、心血管内科、消化内科、肾内科、肝胆外科、胆胰外科、乳腺肿瘤医学部、胃肠外科、血管甲状腺外科、泌尿外科、骨外科、神经外科、整形外科、小儿外科、妇科肿瘤专科、儿科（含神经/内分泌/心血管专科）、神经科（脑血管病专科）、耳鼻喉科、肿瘤科放疗专科、重症医学科等。

年门急诊量约70余万人次，年住院近4万人次，年手术近3万例。

建立细胞分子诊断中心、全自动化组织标本库、肿瘤微创外科平台、肿瘤介入放化疗平台，着力打造精准肿瘤外科诊疗中心（涵盖肝胆、乳腺、泌尿、脊柱、妇科、口腔颌面、胶质瘤、头颈等肿瘤领域）。

配备达芬奇手术机器人、直线加速器等高端设备。

南院区核心专科：肝胆外科（华南肝胆医院定位）、胆胰外科、乳腺肿瘤医学部（逸仙乳腺肿瘤医院，全国首家公立乳腺肿瘤医院，宋尔卫院士任院长）、胃肠外科、泌尿外科、骨外科、妇科肿瘤专科、儿科神经专科。

国家临床重点专科：泌尿外科（华南排名第一）、普外科（含乳腺/肝胆胰方向）、口腔科、儿科血液专科等。

国家重点学科：神经科、急诊科、普通外科、泌尿外科等。

据可名百科所载：中山大学孙逸仙纪念医院（全院口径）现有职工逾5400人，其中卫生专业技术人员占比约82%，高级职称专家逾400人。

注：上述为医院全院口径，非工商登记数据，亦非南院区单独数据；本次检索到的工商登记资料未提供可单独引用的南院区医生、护士具体岗位人数，故不列相关数据。

宋尔卫——院长、中国科学院院士，逸仙乳腺肿瘤医院院长，擅长乳腺肿瘤精准诊疗与肿瘤免疫研究。

王捷——原肝胆外科主任，教授，曾带领肝胆外科主力整体迁入南院区，擅长复杂肝胆胰肿瘤手术及亲体肝移植。

陈亚进——肝胆外科主任医师、教授，中国大陆肝脏领域唯一受邀参与制定国际微创解剖性肝切除专家共识的专家，擅长腹腔镜肝切除。

苏逢锡——乳腺外科主任医师，国内率先推行乳腺癌保乳手术及全程疾病管理。

刘强——乳腺外科主任医师、教授，逸仙乳腺肿瘤医院执行副院长，擅长乳腺癌新辅助治疗及保腋窝手术。

王景峰——党委书记、心血管内科主任医师、教授，心律失常与心脏起搏电生理专家。

谢文练——南院区管委会副主任、泌尿外科主任医师，擅长泌尿系肿瘤腹腔镜手术及男生殖畸形矫治。

黎洪浩——甲状腺外科主任、主任医师，擅长甲状腺癌规范化手术及甲亢外科治疗。

三甲与百年传承：1835年建院（中国第一家西医院），1993年成为广州首家三甲医院；南院区2002年启用，2015年新住院大楼"逸仙楼"（22层、停车3万㎡、近500车位）启用，极大缓解本部空间压力。

国家临床重点专科：泌尿外科（全国第4、华南第1）、普外科、口腔科、儿科血液专科等获评国家临床重点专科。

华南肝胆微创标杆：南院区肝胆外科2003年整体迁入，2007年独立成科，陈亚进教授团队参与制定国际微创肝切除专家共识，被誉为"中国肝脏微创化先驱单位"。

全国首家公立乳腺肿瘤医院：2020年9月逸仙乳腺肿瘤医院在南院区挂牌，系全国唯一由院士领衔的乳腺专科医院，整合11个临床专科提供乳腺肿瘤全周期诊疗。

高难技术突破：完成国内最小亲体肝移植（3月龄婴儿）、华南首例Bernese截骨术、首例Prodisc-C人工颈椎间盘置换、广东省首例腹腔镜直肠癌根治并肝左叶切除等。

荣誉表彰：医院先后获"全国百姓放心示范医院""全国医保管理先进单位""广东省百家文明医院""广东省抗击新冠肺炎疫情先进集体"等。