创建于1941年，前身为新四军第三师后方医院；1975年番号调整为中国人民解放军第一军医大学第一附属医院，1979年经总后勤部批准对外称"南方医院"；2004年随第一军医大学整体转制移交广东省，更名为南方医科大学南方医院。是南方医科大学第一附属医院、第一临床医学院，大型综合性三级甲等医院及国家区域医疗中心。

是国家区域医疗中心建设输出医院、委省共建国家创伤区域医疗中心、国家疑难病症（肿瘤）诊治能力提升工程单位、国家区域中医（风湿病科）诊疗中心、国家紧急医学救援基地、广东省高水平医院"登峰计划"首批重点建设单位、国家住院医师规范化培训示范基地、首批肿瘤多学科诊疗试点医院。

实行多院区布局：院本部（广州市广州大道北1838号）、增城院区（增城区创新大道28号）、知识城院区（黄埔区九龙新城），托管白云分院、太和分院；与赣州市政府共建国家区域医疗中心——南方医院赣州医院。占地约20.3万㎡，建筑面积约45.8万㎡，开放床位约3601张。

设临床科室52个、医技科室15个，涵盖消化内科、感染内科、肾内科、血液科、神经内科、心血管内科、呼吸与危重症医学科、普外科、肝胆外科、神经外科、骨科（创伤/脊柱/关节）、泌尿外科、整形美容外科、妇产科、儿科、急诊科、重症医学科（ICU）、麻醉科、病理科、检验科、影像诊断科等。

年门急诊量约380万人次，年出院约13万人次。

配备双源CT、3.0T核磁共振、DSA、直线加速器、全自动生化流水线等大型设备。

开展器官移植（肝肾）、肿瘤多学科诊疗、神经血管介入、微创外科、整形重建等高难技术；设有惠侨医疗中心（1979年创建的全国首个涉外医疗中心）。

国家重点学科（5个）：内科学（消化系病）等5个；外科学（骨外）为国家级重点培育学科。

国家临床重点专科（17个）：消化内科、感染内科、血液内科、肾内科、肿瘤科、神经外科、骨科、普通外科、整形外科、产科、妇科、口腔科、病理科、检验科等；另有资料口径称国家级临床重点专科共计22个。

国家中医药管理局重点学科：中医科（中西医结合临床重点学科）。

广东省临床重点专科（31个）：心血管内科、消化内科、关节与骨病、皮肤科、放疗科等。

特色平台：慢性肾病国家临床医学研究中心、器官衰竭防治国家重点实验室、广东省肾脏病研究所、广东省肝脏疾病研究所、广东省创伤骨科研究所、南方消化病研究所、国家区域中医（风湿病科）诊疗中心。

特色技术：消化内镜诊治（ESD/ERCP）、病毒性肝炎及肝病综合治疗、血液病造血干细胞移植、肾病一体化治疗、创伤骨科修复重建、整形美容修复、神经外科显微手术、肿瘤MDT综合治疗。

据南方医科大学南方医院2026年公开招聘公告所载：医院现有专业技术人员6800余名，其中高级专业技术人员1100余名，博导201名、硕导252名。

据2024年医师资格考试实践技能考试临床考试基地指引所载：医院专业技术人员5969人，其中高级专业技术人员881人，博导173人、硕导203人。

另据第三方公开资料所载：医院员工总数接近1万人。

拥有中国科学院院士1名、双聘院士7名，长江学者、国家杰青、国家优青、科技部中青年创新领军人才等国家级人才60—70余名。

注：上述为医院招聘公告、考试基地指引及第三方公开资料口径，非工商登记数据；本次检索到的工商登记资料（事业单位法人登记）未提供可单独引用的医生、护士具体人数，故不列相关数据。

本次检索到的官方及工商公开资料仅确认中国科学院院士1名、双聘院士7名及国家级人才70余名，未提供可核实的具体姓名与专长，故不列相关数据。

三甲与A+绩效：1941年建院，系大型综合性三级甲等医院；在2023年度全国公立医院绩效考核中获评A+等级，稳居全国三级综合医院前列。

国家临床重点专科集群：拥有国家重点学科5个、国家临床重点专科17个（另有资料口径为22个），消化内科、肾内科、感染内科、神经外科、整形外科、血液科、病理科等10余个专科进入复旦版中国医院专科声誉榜前十或获提名。

国家级科研平台：设有器官衰竭防治国家重点实验室、慢性肾病国家临床医学研究中心，是"111计划"高等学校学科创新引智基地。

涉外医疗标杆：1979年创建全国首个涉外医疗中心——惠侨楼，2026年入选广东省首批国际医疗服务试点医院；累计服务92个国家和地区患者超26万人次。

科研与教学高地：临床医学为一级学科博士点及博士后流动站，近五年国家自然科学基金年立项数破百（2020年100项，全国医疗机构第12名）；先后获国家科技进步二等奖10项、省部级一等奖30余项。

荣誉表彰：先后获"全国文明单位""全国百姓放心示范医院""全国医院文化建设先进单位""全国抗震救灾英雄集体""全国抗击新冠肺炎疫情先进集体"等荣誉。