始建于1982年12月正式挂牌，1993年建设成为全国最年轻的"三级甲等"医院之一，是大型三级甲等综合性医院、"双一流"高校附属医院、首批广东省高水平临床医学院、广东省中西医协同"旗舰"医院、全国综合医院中医药工作示范单位。

是广州医科大学第二临床学院，附设广州医科大学神经科学研究所、广州心血管疾病研究所、广州医科大学眼科研究所、广州急诊医学研究所。

实行"一院三区"：昌岗院区（海珠区昌岗东路250号）、番禺院区、西院区；总占地约11.1万㎡，建筑面积约22.95万㎡，编制床位2500张。

设46个临床科室、12个医技科室，涵盖过敏反应科、疼痛科、神经内科、心血管内科、神经外科、重症医学科、急诊科、普通外科、康复科、医学检验科、胸外科、肾内科、医学影像科、眼科、内分泌科、呼吸内科等。

在神经系统疾病、心脑血管疾病、过敏性疾病、慢性疼痛诊疗、肾移植及急诊救治等领域达到国内先进水平。

拥有国家住院医师规范化培训专业基地27个，普通外科为全国专科医师规范化培训制度试点专科培训基地，国家药物临床试验机构备案专业32个。

国家临床重点专科（4个）：过敏反应科、疼痛科、急诊科、神经内科。

国家中西医协同"旗舰"科室（1个）：中医科。

"十二五"省级临床重点专科（16个）：过敏反应科、疼痛科、心血管内科、神经外科、重症医学科、神经内科、急诊科、普通外科、康复科、医学检验科、胸外科、肾内科、医学影像科、眼科、内分泌科、呼吸内科。

广东省高水平临床重点专科（3个）：过敏反应科、疼痛科、急诊科。

"十四五"省级临床重点专科（9个）：心血管内科、神经内科、重症医学科、器官移植科、神经外科、眼科、老年病科、风湿免疫科、护理。

特色方向：过敏反应科、疼痛科为国家临床重点专科；神经科学、心血管病、急诊医学、变态反应学为双一流学科。

据广州医科大学附属第二医院官方简介所载：医院现有职工3700余人，其中高级职称631人（2024年口径），博士生导师75人、硕士生导师约300人。

注：上述为医院官方简介口径，非工商登记数据；本次检索到的工商登记资料未提供可单独引用的全院医生及护士具体人数，故不列相关数据。

肖国宏——院长、妇科主任医师、教授、硕导，广东省医师协会生殖医学医师分会主委，擅长宫颈肿瘤、卵巢肿瘤、月经失调及不孕不育诊治。

刘世明——党委书记、心血管内科主任医师、博导，擅长心血管危重症及心血管介入诊治，广东省医学会起搏电生理分会副主委。

邢洲——副院长、神经外科主任医师、教授、硕导，擅长神经外科重症诊断治疗，广东省医师协会神经外科医师分会副主委。

高庆春——神经内科主任、主任医师、教授、硕导，擅长脑血管病诊治及颅脑超声诊断，中国超声医学工程学会颅脑超声专委会常委。

梁剑波——肾内科主任、主任医师、教授、硕导，擅长肾内科疑难危重症诊治及腹膜透析治疗尿毒症，广东省医学会血液净化学分会副主委。

李万根——内分泌科主任医师、博导，擅长内分泌代谢病诊治。

区文超——心血管内科副主任、主任医师、教授、硕导，擅长冠心病、高血压、心力衰竭、心肌病及心律失常诊治。

崔永生——副院长、心内科主任医师、博导，擅长高血压、冠心病等心内科疾病诊治。

三甲与高水平建设：1982年建院，1993年成为全国最年轻的三甲医院之一；入选首批广东省高水平临床医学院、广东省中西医协同"旗舰"医院。

国家临床重点专科集群：过敏反应科、疼痛科、急诊科、神经内科4个专科获批国家临床重点专科；过敏反应科与疼痛科亦为广东省高水平临床重点专科。

科研与教学平台：附设广州医科大学神经科学研究所、心血管疾病研究所、眼科研究所、急诊医学研究所；拥有省部共建教育部重点实验室等各级重点实验室11个，近五年获科研经费2.5亿余元，承担国家自然科学基金等各级项目700余项。

荣誉表彰：先后获"全国卫生系统先进集体""广东省文明医院""广东省百家文明医院""广州市最受欢迎三甲医院""广州市医保信用AAA级定点医疗机构"等荣誉。