创办于1956年，由爱国华侨陈应龙等人创办，2009年通过评审成为三级甲等综合性中医院，2022年获批福建省唯一中医类国家区域医疗中心建设项目。

是北京中医药大学第八临床医学院（北京中医药大学东直门医院厦门医院）、福建中医药大学附属厦门中医院、厦门大学教学医院、国家中医住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构（GCP）、国家级博士后科研工作站。

一院三区：总院（湖里区仙岳路1739号）、南区、思明分部（禾祥东门诊部）；建筑面积约17.9万平方米，编制床位1200张。

集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体，是国家卫生健康委建立健全现代医院管理制度全国试点单位，获批厦门市应急医院。

设临床科室40余个、医技科室10余个，涵盖肝病中心（肝病科一/二/三区、肝胆胰外科）、肛肠病医院（肛肠科一/二区）、脾胃病科、儿科、心血管科、脑病科、肺病科、肾病科、内分泌科、风湿病科、肿瘤科、妇科、产科、骨伤科（一/二/三区）、普外科、泌尿外科、神经外科、针灸科（一/二/三区）、康复科、推拿科、治未病中心、急诊科、ICU等。

2025年门急诊量约246.9万人次，年出院约6.2万人次，年手术量逾2万台次（四级手术占比10%以上）。

配备3.0T核磁共振、256排CT、DSA、DR、全自动生化流水线、电子胃肠镜、腹腔镜/宫腔镜及中医特色诊疗设备。

开展中药内服外用、针灸、推拿、拔罐、穴位贴敷等传统疗法，结合现代微创外科、介入及重症救治技术。

国家临床重点专科（2个）：肝病科、儿科。

国家中医药管理局重点学科（1个）：中医肝胆病学。

国家中医药管理局重点专科（4个）：肝病科、肛肠科、儿科、脾胃病科。

国家中医药管理局重点专科建设单位（2个）：骨伤科、风湿病科。

国家中医药管理局中医优势专科（4个）：肝病科、肛肠科、外科、儿科。

福建省创双高临床重点专科（中医类，5个）：脾胃病科、风湿病科、骨伤科、糖尿病科、针灸康复科。

福建省重点专科（16个）：肝病科、肝胆外科、中西医结合胆胰专科、糖尿病科、中西医结合骨关节病、中医痔疮专科、中西医结合儿科、脾胃科、中药临床药学、中医护理、中医眼科、妇科、老年病科、乳腺科、心血管科、肾病科。

厦门市医学领先学科（3个）：肛肠科、中西医结合儿科、肝病科。

特色技术：中西医结合诊治各型病毒性肝炎、肝硬化、肝癌（肝外科开展半肝/三肝切除、胰十二指肠切除、肝移植探索）；肛肠科PPH、TST、肛瘘LIFT等微创；儿科中西医结合治疗呼吸系统疾病、消化系统疾病及儿童保健；脾胃病科ESD/EMR及ERCP；针灸康复科中风后遗症康复；中药制剂研发与转化。

据医院官方简介所载：全院职工约2092人，其中高级卫生专业技术人员516人，硕博士614人，博士生导师15人、硕士生导师86人，享受国务院政府特殊津贴专家3人，全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师7人，福建省名中医7人。

本次检索到的官方资料未提供可单独引用的全院医生及护士具体人数，故不列相关数据。

尹震宇：肝外科主任医师、博导，擅长复杂肝癌切除、腹腔镜肝胆手术及肝移植技术。

康俊杰：原肝病中心主任、主任医师，全国名老中医康良石学术继承人，擅长中西医结合治疗肝病、肝纤维化。

阮清发：肝病科二区主任、主任医师、硕导，福建省康氏中医肝病流派传承人，擅长各型肝病的中西医结合诊治。

蔡虹：肝病中心主任医师，全国名老中医康良石教授主要学术继承人，擅长中西医结合治疗急、慢性病毒性肝炎、肝硬化腹水、脂肪肝、酒精肝、黄疸及胆道疾病。

吴耀南：原副院长、脾胃病科主任医师、教授，第六批全国老中医药专家学术经验继承指导老师，擅长运用脾胃学说治疗消化系统疾病及内科疑难杂症。

陈联发：副院长、心血管内科主任医师、硕导，擅长冠心病介入及中西医结合心脏康复。

林安基：脑病科主任、主任医师、教授，擅长中风病、痴呆、头痛、眩晕、睡眠障碍及帕金森病诊治。

王朝阳：心血管内科主任、主任医师，擅长冠心病、高血压、心律失常及慢性心衰中西医结合治疗。

叶向荣：内分泌代谢病科主任、主任医师，擅长糖尿病、甲状腺疾病及垂体肾上腺疾病诊治。

邱明山：风湿病科主任、副主任医师，擅长风湿免疫病及内科疑难杂症的中西医结合治疗。

张琼英：呼吸内科主任、主任医师、副教授，擅长呼吸系统疾病的诊断治疗。

三甲中医院与国家区域医疗中心：1956年建院，2009年通过三级甲等综合性中医院评审；2022年获批福建省唯一中医类国家区域医疗中心建设单位，加挂"北京中医药大学东直门医院厦门医院"。

重点专科集群：拥有国家临床重点专科2个（肝病科、儿科）、国家中医药管理局重点学科1个（中医肝胆病学）、国家中医药管理局重点专科4个、国家中医优势专科4个，省级重点专科16个，市级领先学科3个，数量居福建省中医系统首位。

康氏肝病学术流派：形成"厦门康氏肝病学术流派"，建有康良石、康俊杰名老中医工作室，出版《肝脏七病诊断与治疗》，院内制剂"康氏抗纤颗粒"等广泛应用。

对台与国际交流：2017年获批国家中医药管理局对台中医培训交流基地，承担港澳台侨同胞中医诊疗（港澳侨台胞诊疗中心）；2022年获批国家中医药服务出口基地，中医药服务辐射40余个国家与地区。

绩效考核与荣誉：2019—2022年国家公立三级中医院绩效考核福建省排名第一，2022年全国第58位，2023年等级A级；先后获"全国文明单位""全国卫生系统先进集体""福建省抗击新冠肺炎疫情先进集体"等荣誉。