始建于1928年，由爱国华侨捐资兴建，首任院长为时任厦门大学校长林文庆博士，1988年迁址重建后复办开诊，2005年成为厦门大学首家附属医院，是三级甲等综合医院，集医疗、教学、科研、预防、保健于一体。

是厦门大学医学院第一临床学院、国家住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构（GCP）、国家消化系统疾病临床医学研究中心福建省分中心、国家高级卒中中心。

一院多区：院本部位于厦门市思明区湖滨南路201—209号，另设金榜分部、厦禾分部（东部分院在建）；院本部占地约5.7万平方米，建筑面积约17.1万平方米，编制床位2500张。

设临床及医技科室约50个，涵盖消化内科、大普外科（肝胆胰外科、胃肠外科、血管外科、乳腺外科）、骨科（关节外科与运动医学科、脊柱外科、创伤骨科、手足与显微外科）、心血管内科、神经内科、呼吸与危重症医学科、肾内科、内分泌科、血液科、肿瘤科、急诊科、重症医学科（ICU）、麻醉科、检验科、康复医学科、皮肤科、中医科等。

年门急诊量约200万人次，年出院约8.7万人次，年手术量约5万台次。

配备PET-CT、3.0T核磁共振、320排CT、DSA、直线加速器、全自动生化流水线及数字化手术室。

与国内多家知名医疗机构建立学术协作，开展远程会诊与专家交流。

国家临床重点专科（4个）：消化内科、大普外科、骨科、检验科。

福建省临床重点专科（15个）：消化内科、肝胆胰外科、大普外科、肾内科、康复医学科、皮肤科、中医科、神经内科、骨科、重症医学科、呼吸与危重症医学科、医学检验科、临床护理、神经外科、心内科。

厦门市领先/重点学科：消化内科、肝胆胰外科、胃肠外科、关节外科（市领先学科）；神经内科、血液科、内分泌科、超声科、胸外科、肿瘤与血管介入科、专科护理（市临床重点学科）。

特色中心：国家消化系统疾病临床医学研究中心福建省分中心、国家高级卒中中心、福建省肺恶性肿瘤专病中心、海峡精准医学中心、微生态诊疗中心。

特色技术：消化道早癌内镜诊治（ESD/EMR）、肝胆胰及胃肠肿瘤腹腔镜/机器人手术、关节置换与脊柱微创、冠脉介入与复杂心律失常射频消融、急性脑梗取栓。

据医院官方及权威医疗信息平台所载：全院职工约3300人，其中卫生专业技术人员约3100人（医生约1100人、护士约1600人、医技约400人），高级职称约1036人，硕士/博士约956人，博士生导师与硕士生导师约135人，享受国务院特殊津贴专家11人。

注：上述为医院官方公开口径，非工商登记数据；本次检索到的工商登记资料未提供可单独引用的全院医生及护士具体人数，故不列相关数据。

尹震宇：院长、肝胆胰外科主任医师、博导，擅长肝脏外科、胆胰复杂癌肿根治术及肝移植。

任建林：副院长、消化内科主任医师、博导，擅长胃肠黏膜病变与消化道肿瘤早诊早治、肠道微生态。

蔡建春：胃肠外科主任医师、教授，擅长胃癌、结直肠癌腹腔镜微创手术及NOSES手术。

林勤：党委书记、肿瘤放疗科主任医师、博导，擅长胸部肿瘤放疗及肺癌MDT顶层设计。

柯孙葵：胸外科主任、主任医师、教授，擅长肺癌、食管癌微创手术及肺功能保护。

郑维红：神经内科主任、主任医师，擅长癫痫、帕金森病、脑血管病诊治。

关天俊：肾内科主任、主任医师，擅长肾病综合征、糖尿病肾病、慢性肾衰诊治。

黄卫斌：心血管内科主任医师，擅长复杂心律失常射频消融及心脏起搏器植入。

白培明：泌尿外科主任、主任医师，擅长前列腺癌、肾癌、膀胱癌微创手术。

夏春：骨科主任医师、博导，擅长关节置换、运动损伤及骨肿瘤诊治。

鹿全意：血液内科主任、主任医师，擅长白血病、淋巴瘤的造血干细胞移植及细胞治疗。

沈兴平：内分泌科主任、主任医师，擅长糖尿病、甲状腺及垂体肾上腺疾病诊治。

三甲综合医院与厦大首家附属医院：1928年建院，2005年成为厦门大学首家附属医院，2019—2022年连续四年在全国三级公立医院绩效考核中获A+评价，并连续入选中国医院竞争力"顶级医院100强"。

国家临床重点专科集群：拥有消化内科、大普外科、骨科、检验科4个国家临床重点专科（含建设项目），数量并列厦门市首位。

科研与教学突破：2010—2015年国家自然科学基金立项连续六年全省第一；2017—2018年Nature自然指数排行厦门第一；2020年牵头成立厦门大学医学院首个学系——消化病学系，2021年牵头成立厦门大学耳鼻咽喉头颈外科学系；2025年国家自然科学基金立项金额居厦门各医院首位。

肿瘤与微生态平台：建成海峡精准医学中心（福建省规模最大精准医学平台）、福建省微生态诊疗中心，获批福建省肺恶性肿瘤专病中心。

国际医疗与两岸融合：2025年6月成立国际医疗部，打造"医疗+康养+文旅+保险"融合生态；成立台胞医疗与保健服务培训中心、厦门大学海峡医学中心，推动两岸医学交流。

荣誉表彰：先后获"全国卫生系统先进集体""全国文明单位""福建省文明单位""厦门市文明单位"等荣誉。