前身为1848年英国皇家海军与领事馆合办的"海港医馆"，1887年迁现址易名"塔亭医院"，1956年定名福州市第二医院，1984年增挂"福建省福州中西医结合医院"，1996年通过全国首批三级甲等中西医结合医院评审，2024年12月通过三级甲等综合性医院评审，现为三级甲等综合医院（兼三甲中西医结合）。

是厦门大学附属福州第二医院、国家级住院医师规范化培训基地、全国十家重点中西医结合医院之一、福建省公立医院高质量发展示范医院试点单位。

2023年5月牵头整合福建省福州神经精神病防治院、福州市妇幼保健院，组建福州市第二总医院，实行"一院多区"同质化管理。

主院区位于福州市仓山区上藤路47号（烟台山麓），核定床位2800张。

设临床科室40余个、医技科室10余个，涵盖创伤骨科、关节外科、脊柱外科、小儿骨科、手外科、足踝外科、骨与软组织肿瘤外科、康复医学科、重症医学科、急诊科、心血管内科、神经内科、神经外科、呼吸与危重症医学科、消化内科、内分泌科、肝胆外科、普外科、泌尿外科、妇产科、儿科等。

年门急诊量约150万人次，年出院约5万人次，年手术量约3万台次。

配备3.0T核磁共振、256排CT、DSA、数字化手术室、ECMO、脊柱机器人、全自动生化流水线及高压氧舱等设备。

为国家骨科与运动康复临床医学研究中心核心单位、国家卫健委骨科专项能力培训教学基地、国家级显微外科技能培训中心。

国家级重点专科（3个）：骨伤科、重症医学科（中西医结合方向）。骨科为福建省最大骨科中心之一，设创伤、关节、脊柱、小儿骨科、手外、足踝、骨肿瘤、运动医学、骨内科9个亚专业。

省级临床重点专科：骨科、康复医学科、小儿骨科、神经内科（西医类）；骨伤康复科、神经外科、心血管内科、急诊科、肝胆内科（中医类）。

市级重点专科：呼吸内科、消化内科、内分泌科、肿瘤科、儿科等。

特色中心：福州市创伤医学中心、福州市神经医学中心、福州市骨伤康复中心、国家级胸痛中心、国家高级卒中中心建设单位。

特色技术：四肢复杂骨折微创内固定、髋膝肩肘关节置换与翻修、脊柱退变微创与畸形矫正、足踝畸形矫正、中西医结合骨伤康复、急诊冠脉介入、急性脑梗取栓。

据医院官方简介所载：福州市第二总医院核定编制2639名，职工约3200—3223人，其中卫生专业技术人员占比约88%，高级职称约487—511人，博硕士约576—632人，硕博士研究生导师约20余人。

官方资料未提供可单独引用的全院医生及护士具体人数，故不列相关数据。

林凤飞：院长、创伤三科主任医师、博导，擅长四肢骨折、老年髋部骨折、骨缺损/骨感染/骨不连及足踝外科诊治。

张怡元：大骨科行政主任、关节一科主任医师、教授，擅长人工髋膝关节置换与翻修、保髋保膝术及3D打印技术应用。

陈国龄：脊柱二科主任医师（享受国务院特殊津贴），擅长关节置换、关节镜、骨关节创伤及腰骶椎退行性疾病。

梁珪清：脊柱一科主任医师、硕导，擅长脊髓损伤、脊柱退行性病变及脊柱畸形诊治。

陈顺有：小儿骨科主任、主任医师，擅长儿童复杂创伤、先天性畸形及肢体矫形与重建。

郑明：创伤四科主任医师，擅长四肢骨折、老年骨质疏松骨折微创治疗及足踝创伤/畸形矫正。

翁绳健：关节二科主任医师，擅长老年髋膝关节疾病、人工关节置换及股骨头坏死治疗。

马国斌：心血管内科主任医师，擅长冠心病介入、起搏电生理及高血压/心衰诊治。

蒋小玲：神经内科主任医师、教授，擅长急性脑血管疾病、帕金森病及痴呆诊治。

佘晖：呼吸内科主任医师，擅长慢阻肺、哮喘、肺部感染及肺间质病诊治。

三甲双评审：1996年通过全国首批三级甲等中西医结合医院评审，2009年入选全国十家重点中西医结合医院，2024年12月通过三级甲等综合性医院评审。

骨科区域龙头：骨科创建于1958年，现设9个亚专业、床位600余张，年骨科手术量近3万例，为华东地区规模最大的骨科中心之一，"看骨科，就到福州市二"成为本地公认口碑。

国家级与省级中心建设：获评国家级胸痛中心、国家高级卒中中心建设单位，福州市创伤医学中心、神经医学中心、骨伤康复中心挂靠单位。

国考成绩：2023、2024年度连续两年获全国三级公立医院绩效考核"A+"等级，2022年入选福建省公立医院高质量发展示范医院试点单位。

教学与科研：为福建医科大学、福建中医药大学博硕士培养基地，国家级住院医师规范化培训基地，拥有省级骨科与运动康复临床医学研究中心及多项国家/省级科研平台。

荣誉表彰：先后获"全国卫生系统先进集体""福建省文明单位""2025年福州市劳动模范集体"等数十项荣誉。