前身为1881年英国教会创办的"泉州惠世医院"，1973年定名为福建医科大学附属第二医院，是三级甲等综合医院，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体。

是福建医科大学第二临床医学院、国家住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构（GCP）、福建省首批省级区域医疗中心，编制床位约2500张。

一院两区：鲤城院区（泉州市鲤城区中山北路34号）、东海院区（泉州市丰泽区东海大街960号）；是闽南地区历史最悠久、规模最大的三级甲等综合医院之一。

设临床科室50余个、医技科室20个，涵盖心血管内科、神经内科、呼吸与危重症医学科、消化内科、内分泌科、肾内科、血液科、普外科、骨科、神经外科、泌尿外科、心胸外科、妇产科、儿科、急诊科、重症医学科（ICU）、麻醉科、病理科、检验科、影像科等。

年门急诊量约200万人次，年出院约9万人次，年手术量约4万例次。

配备PET-CT、3.0T核磁共振、256排CT、DSA、直线加速器、ECMO、全自动生化流水线及数字化手术室。

与北京协和医院、上海中山医院、瑞金医院等建立学术协作，承担福建医科大学临床医学、医学影像学、麻醉学等专业教学任务。

国家临床重点专科（2个）：普通外科、眼科。

福建省临床重点专科（12个）：心血管内科、神经内科、呼吸与危重症医学科、消化内科、骨科、神经外科、泌尿外科、妇产科、儿科、急诊科、麻醉科、病理科。

特色诊疗中心：胸痛中心（国家级）、卒中中心（高级卒中中心）、创伤救治中心、危重孕产妇救治中心、危重新生儿救治中心、眼科诊疗中心、消化内镜中心。

特色技术：腹腔镜胃肠肝胆胰微创手术（普外科）、复杂冠脉介入与TAVR（心内科）、急性脑梗取栓与复杂动脉瘤介入（神经外科）、脊柱微创与关节置换（骨科）、白内障超声乳化与眼底手术（眼科）、ECMO支持下的重症救治。

据医院官方简介所载：全院职工约3500人，其中卫生专业技术人员约2900人（医生约950人、护士约1450人、医技约500人），高级职称约450人，博士生导师30余人、硕士生导师120人，博士/硕士学历人员占比约40%。

官方资料未提供可单独引用的全院医生及护士具体人数，故不列相关数据。

曾奕明：原院长、呼吸与危重症医学科主任医师、博导，擅长支气管镜介入诊疗、慢阻肺及肺癌诊治，享受国务院特殊津贴。

林建银：原副院长、消化内科主任医师、博导，擅长消化道早癌内镜诊治（ESD/EMR）、慢性肝病及胰腺疾病。

李毅中：副院长、骨科主任医师、博导，擅长脊柱微创（椎间孔镜）、关节置换及骨质疏松性骨折诊治。

黄志扬：普通外科主任、主任医师、博导，擅长胃癌、结直肠癌及腹腔镜肝胆胰手术。

吴友谊：心血管内科主任、主任医师、博导，擅长冠心病介入、心律失常射频消融及起搏器植入。

蔡若蔚：神经内科主任、主任医师、博导，擅长脑血管病、神经免疫性疾病及帕金森病诊治。

黄金钟：眼科主任、主任医师、博导，擅长白内障超声乳化、青光眼及眼底病诊治。

林元相：神经外科主任、主任医师、博导，擅长脑动脉瘤夹闭/介入、脑肿瘤显微手术及癫痫外科。

郑志群：妇产科主任、主任医师、博导，擅长妇科肿瘤腹腔镜手术、高危妊娠及生殖内分泌疾病。

王瑞泉：儿科主任、主任医师，擅长新生儿危重症、儿童呼吸道/消化道疾病诊治。

许建华：原副院长、肿瘤科主任医师、博导，擅长肺癌、结直肠癌及乳腺癌综合治疗。

万建新：原副院长、肾内科主任医师、博导，擅长慢性肾病、透析及肾移植内科管理。

三甲创建与区域中心：1881年建院，1993年通过三级甲等医院评审，2021年入选福建省首批省级区域医疗中心建设单位。

国家临床重点专科：普通外科、眼科为国家临床重点专科，数量居福建省地市医院前列。

重点专科建设：拥有心血管内科、神经内科、呼吸与危重症医学科、消化内科、骨科、神经外科、泌尿外科、妇产科、儿科、急诊科、麻醉科、病理科等12个福建省临床重点专科。

百年惠世传承：前身为1881年英国教会创办的惠世医院，是福建省现代医学发源地之一，2021年医院建院140周年之际出版《惠世百年》院史。

教学与科研：作为福建医科大学第二临床医学院，承担本科、硕士、博士及住培任务；近五年承担国家自然科学基金30余项，发表SCI论文数百篇；拥有福建省呼吸疾病重点实验室等省级平台。

荣誉表彰：先后获"全国文明单位""全国卫生系统先进集体""福建省抗击新冠肺炎疫情先进集体""全国百姓放心示范医院"等荣誉。