前身为海淀区卫生院，1948年改为北平市立海淀医院，1949年更名北京市立海淀医院，1951年定名为北京市海淀医院，2008年成为三级综合医院，2013年与北京大学第三医院深度合作，挂牌北京大学第三医院海淀院区。

是北京市医保定点医院、海淀区区域医疗中心、首都医科大学和北京大学医学部教学医院、北京市住院医师规范化培训基地。

地址：北京市海淀区中关村大街29号；占地约4万平方米，建筑面积约10万平方米，编制床位800张（开放约800张）。

集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体，承担中关村科学城及海淀区中部百万人口医疗保障、高校师生服务及基层医联体技术指导职能。

设临床科室30余个、医技科室10余个，涵盖心血管内科、神经内科、呼吸与危重症医学科、消化内科、内分泌科、肾内科、普外科、骨科、神经外科、泌尿外科、妇产科、儿科、急诊科、重症医学科（ICU）、康复医学科、中医科、眼科、耳鼻喉科、口腔科等。

年门急诊量约200万人次，年出院约3.5万人次，年手术量约1.5万例次。

配备3.0T核磁共振、256排CT、DSA、数字化手术室、ECMO、全自动生化流水线及高压氧舱等设备。

与北京大学第三医院实行同质化管理，北医三院专家定期出诊、查房、手术及疑难病例会诊。

北京市临床重点专科：神经内科、消化内科、骨科、急诊科。

海淀区重点学科：心血管内科（胸痛中心）、普外科（微创外科）、妇产科（高危产科）、儿科（新生儿）。

特色中心：胸痛中心、卒中中心、创伤救治中心、危重孕产妇救治中心、危重新生儿救治中心、消化内镜中心、血液透析中心。

特色技术：冠心病介入、急性脑梗取栓、腹腔镜胃肠肿瘤手术、脊柱微创与关节置换、高危妊娠管理、运动医学与关节镜。

据医院官方简介所载：全院职工约1800人，其中高级职称约230人，博士生导师8人、硕士生导师20人，博士/硕士学历人员占比约40%。

官方资料未提供可单独引用的全院医生及护士具体人数，故不列相关数据。

张福春：院长、心血管内科主任医师、博导，擅长冠心病介入、心力衰竭及复杂心血管病诊治。

刘晓光：北医三院副院长、海淀院区院长、骨科主任医师、博导，擅长脊柱微创、颈椎与腰椎退变性疾病诊治。

沈扬：常务副院长、神经内科主任医师，擅长脑血管病、眩晕及神经肌肉病诊治。

李葆华：副院长、护理部主任，擅长护理质量管理与专科护理建设。

王艳：消化内科主任、主任医师，擅长消化道早癌内镜诊治（ESD/EMR）、胆胰疾病ERCP。

周谋望：康复医学科主任、主任医师、博导，擅长骨科康复、运动损伤康复及神经康复。

马潞林：泌尿外科主任、主任医师、博导，擅长腹腔镜前列腺癌根治、肾癌保肾手术及泌尿系肿瘤微创治疗。

赵扬玉：妇产科主任医师、博导，擅长高危妊娠、产科急危重症及胎儿医学。

崔郁：急诊科主任、主任医师，擅长中毒、休克及多器官功能衰竭综合救治。

三级综合医院与北医三院深度合作：1948年建院，2008年晋升三级综合医院，2013年挂牌北医三院海淀院区，实行"一套班子、两块牌子"同质化管理，海淀区中部优质医疗资源供给大幅提升。

五大中心建设：通过国家级胸痛中心、卒中中心、创伤救治中心认证，建立危重孕产妇、危重新生儿救治中心，急性心梗DNT、卒中DNT时间达北京市先进水平。

重点专科建设：神经内科、消化内科、骨科、急诊科为北京市临床重点专科；心血管内科、普外科、妇产科、儿科为海淀区重点学科。

教学与科研：作为北京大学医学部、首都医科大学教学医院，承担本科及研究生教学、住院医师规范化培训任务；近五年承担国家级、省部级课题30余项，获实用新型专利20余项。

荣誉表彰：先后获"全国百姓放心示范医院""北京市文明单位""北京市改善医疗服务示范医院""海淀区先进基层党组织"等荣誉。